제시하신 문장에 쓰인 ‘머리'와 '뇌리’, ‘스치다'와 '지나가다’는 뜻이 겹치는 면이 있습니다.
뇌와 중추 신경 등이 들어 있는 ‘머리’와 사람의 의식이나 기억, 생각 따위가 들어 있는 영역을 이르는, ‘뇌중(腦中)’과 같은 말인 ‘뇌리’가 그러하고, "어떤 느낌, 생각, 표정 따위가 퍼뜩 떠올랐다가 이내 사라지다."라는 뜻의 ‘스치다’와 "어떤 표정이나 예감, 생각 따위가 머리를 스쳐 가다."라는 뜻의 ‘지나가다’가 그러합니다.
이런 점을 고려하여, ‘머리를 지나가다’, '머리를 스치다' 또는 ‘뇌리를 스치다’처럼 표현하는 것이 적절하겠습니다.
출처: 국립국어원